Episoomiliigid ja nende omadused



A episoom, geneetika valdkonnas on see DNA molekul, mis on võimeline peremeesraku tsütoplasmas autonoomselt replitseeruma ja mis on peremees-kromosoomi füüsiliselt integreeritud, samuti kordub see ühe molekulina (mida me nimetame kointegratsiooniks) ).

Episoomis seega tõlgendada kui viis kooseksisteerimise ja mitte tüüpi replikoni. Tegelikult on mõned autorid, transponsoone ja sisestamise järjestusi võib pidada episoomidest sest see tõhusalt viiakse kromosoomis peremeesraku, kuid mitte kunagi olla iseseisev ja sõltumatu olemasolu tsütoplasmas.

Eukarüootsetes rakkudes tähendab seevastu episoom rohkem viiruse replikone, mis eksisteerivad nakatunud rakkudes samaaegselt plasmiididena kui viiruste suhtes, mida saab integreerida peremeesraku genoomi..

See ei ole ainus näide, kus sama sõna tähendab erinevaid asju eukarüootides ja prokarüootides (näiteks termin transformation). Episoomidel on kaasaegse geneetika arengus rikas ajalugu, kuna nad aitasid pärandiga seotud huvitavaid nähtusi lahti harutada.

Indeks

  • 1 Episoomid, mis on bakteriofaagid
  • 2 Episoomid, mis on plasmiidid
  • 3 Episoomid eukarüootsetes rakkudes
  • 4 Järeldused
  • 5 Viited

Episoomid, mis on bakteriofaagid

Üheks klassikaliseks näiteks episoomidest on bakteriofaag lambda oma peremeesbakteris, millest kõige tuntum on Escherichia coli. Bakteriofaag (lühendatud faag) on ​​viirus, mis nakatab baktereid.

Tingimustes, mis viivad infektsioon bakterid faagi, viiruse genoomi tsütoplasmas kehtestati lineaarne molekul võib Patrullid ja kohaspetsiifiline rekombinatsioonisündmustest, kromosoomi integreerunud vastuvõtva bakter.

Faagi genoomi sees on lühike nukleotiidide järjestus (attλ), mis on täielikult komplementaarne bakteri ümmarguse kromosoomi sidumissaidiga (kinnitus)..

Nende kahe saitide vahelise rekombinatsiooni korral tekib kahe ringi vahel kointegratsioon, mis tekitab suurema ringi. Kui bakterite kromosoomi replikeeritakse, replitseeritakse viiruse genoomi (episoomi olekus).

See võib juhtuda lõputute põlvkondade puhul - kui induktiivne sündmus ei vii viiruse genoomi lõhustumiseni ja sellele järgneva viiruse autonoomsesse replikatsioonitsüklisse, mis kulmineerub bakterite lüüsi, et vabastada uued virioonid.

Episoomid, mis on plasmiidid

Veel üks tuntumaid episoomide näiteid on viljakustegur või plasmiid F. Mõnikord, sõltuvalt peremeesbakteri nukleotiidist (nt E. coli), rekombineerub ringikujuline plasmiid kromosoomil olevate homoloogsete kohtadega. bakterid, mis põhjustavad kointegratsiooni.

See tähendab, et plasmiid võib paljuneda väikese koopiate arvuga bakterite tsütoplasmas või, kui see on integreeritud, paljuneda tervikuna paljudes koopiates, mis vastavad bakterite ilma F (tavaliselt üks) bakteritele..

Episoomi staatusena annab F bakteritele võime pärast konjugatsiooniprotsessi toota suurt hulka rekombinante..

F + bakter (see tähendab, et sellel on autonoomne plasmiid F), mis läbib selle elemendi sisestamise, on väidetavalt Hfr (rekombinatsiooni kõrge sagedusega, selle lühendina inglise keeles), kuna konjugatsiooni korral on see teoreetiliselt võimeline "bakterit" kromosoomi "lohistama" F- (st puudulikkuse faktoriga või plasmiidi F) bakteritega.

Üldiselt on järjestused, mis tagavad homoloogia (ja seega ka sarnasuse ja komplementaarsuse) F-plasmiidi ja bakteriaalse kromosoomi vahel, et kontrollida spetsiifilist koha rekombinatsiooniprotsessi, mis tekitab kointegratsiooni, on sisestamisjärjestused.

Episoomid eukarüootsetes rakkudes

Ajaloolistel põhjustel oli termin episome (ülalpool + keha) alati seotud plasmiidi omaga, mis pärineb algselt prokarüootide ekstrakromosomaalsete elementide maailmast.

Leida sarnaseid elemente eukarüootides nende kasutamise vastu määrama molekulide viiruste genoomidest võimelised ise seda tüüpi nakatunud rakke, mis meenutaks omadusi plasmiidid prokarüootsetes.

See tähendab, et nakatunud eukarüootsetes rakkudes viirustega võib leida mõningatel juhtudel osana oma replikatsioonitsükli viirus eksisteerivad rakus DNA molekuli sellised need teised ümmarguse replikonidele kirjeldatud näiteks, bakterid.

Kõige levinumad viirused, mis võivad eksisteerida autonoomse replikatsiooni (peremehe kromosoomist) ringikujuliste DNA molekulidena, kuuluvad perekondadesse Herpesviridae, Adenoviridae ja Polyomaviridae..

Ükski neist siiski on genoomi integreeritud hospedador- põhjus, miks võib pidada imiteerida näiteks plasmiidid, mis ei vasta omapära, mis iseloomustab episoomil: integreeritud peremehe genoomi.

Kuigi termini kõrvaldamine on välja pakutud, võib see ainult segadust tekitada teema suhtes, mis on juba üsna keerukas..

Järeldused

Lühidalt öeldes võime öelda, et etümoloogiliselt kõnelev episoom on autonoomse replikatsiooni geneetiline element, mis võib rakus eksisteerida vaba DNA molekulina või olla füüsiliselt integreeritud peremeesorganismiga.

Vaatepunktist geneetika siiski episoomil on plasmiid või viirus, mis võib genoomi integreeruda prokarüootsete või olla üks liiki plasmiidid, mis mahutab eukarüootne rakk.

Huvitaval kombel ei peeta episoomideks eukarüootse peremehe (retroviiruse) genoomi sisestatavaid viirusi.

Viited

  1. Brock, T. D. 1990. Bakteriaalse geneetika tekkimine. Cold Spring Harbour Laboratory Press. Cold Spring Harbor, MA, Ameerika Ühendriigid.
  2. Griffiths, A.J.F., Wessler, S.R., Carroll, S.B. & Doebley, J. Sissejuhatus geneetilisse analüüsi. W. H. Freeman & Co, McMillan Publishers. London, Ühendkuningriik.
  3. Hayes, W. 1971. Bakterite ja nende viiruste geneetika, teine ​​väljaanne. Blackwelli teaduslikud väljaanded.
  4. Jacob, F. & Wollman, E. L. 1958. Les épisomes, elements génétiques ajoutés. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154-156.
  5. Levy, J. A., Fraenkel-Conrat, H. & Owens, O. S. 1994. Virology, 3. väljaanne. Prentice'i saal. Englerwood Cliffs, NJ, Ameerika Ühendriigid.